細菌基因組測序
細菌基因組測序
【添加時(shí)間:2016-09-22 10:10:13】【來(lái)源:】【作者:dggadmin】
       由于具有讀長(cháng)長(cháng)的特點(diǎn),第三代測序平臺在基因組測序中能降低測序后的Contig數量,明顯減少后續的基因組拼接和注釋的工作量,節省大量的時(shí)間。
       SMRT測序技術(shù)做細菌全基因組測序的技術(shù)路線(xiàn)如下:
       文庫構建 -> PacBio測序 -> 序列組裝 ->  繪制基因組完成圖 -> 生物信息分析

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圖1 細菌全基因組測序流程

       生物信息分析包括:基因預測及功能注釋、基因家族分析、共線(xiàn)性分析、非編碼RNA注釋、重復序列注釋、CRISPR預測、前噬菌體預測、基因島預測等。

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圖2 基因組及甲基化組完成圖示例
      



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